Application biologique des composés spiro

Les molécules ont été dessinées à l'aide du freeware ACD Chemsketch 12, suivi d'une optimisation énergétique à l'aide du champ de force MMFF94 en utilisant TINKER. Les pdb des protéines ont été téléchargées à partir de Protein databank (www.rcsb.org). Les protéines ont d'abord été soumises à la minimisation de l'énergie, à la protonation, puis à la détection de l'identification du site. Le récepteur et les candidats médicaments ont été optimisés avant l'arrimage proprement dit, suivi de l'arrimage dans MOE 2012.10 en utilisant la procédure standard mentionnée dans le manuel du logiciel. Les molécules ont été dockées dans le site actif en utilisant le 'champ de force' comme technique de raffinement avec les paramètres par défaut dans MOE 2012.10. Toutes les molécules nouvellement synthétisées ont été arrimées dans le site actif de l'AChE (pdb- 1GQR, résolution aux rayons X = 2,20 Ao). Pour la présente analyse, l'enoyl acyl carrier protein reductase (InhA) de M. tuberculosis catalysant la réduction spécifique au NADH du 2-trans-enoyl-ACP (pdb : 2H7M, Résolution= 1,62Å) a été utilisée. Par souci de commodité et à des fins de comparaison, nous présentons, à titre représentatif, les poses de docking pour le composé actif de chaque série.